美国社会中，长时间存在着“达尔文进化论”与“智能设计论”的激烈争论，而且这种争论是在学术、文化、法律、宗教等各个方面同时进行着的。“智能设计论”者坚信自然是被智能设计的，他们对自然界怀着虔诚的宗教情感，并拥有自己的论证逻辑：世界——特别是生物体的构造——是如此复杂、美妙和和谐，它们不可能是随机自然形成的，而只能是由智能设计者有目的地创造出来的。然而，当代学术界已经对这些声音越来越不在意了，并且在运用“进化论”中的手段来处理这些异见，那就是“不适者，不生存”。坚信“智能设计论”的学者本斯坦饰演正处在这场斗争的“失败者”的位置，而本片也是以他的故事为中心，通过和他持一样观点的学者和科学家的遭遇，展现了“达尔文进化论”在当下的统治力量：一位科学家不论有多少成就，如果他胆敢从科学研究的立场对进化论提出质疑，他就“大限”已到，会遭受到学术上的打压和放逐的命运，晋升会遭到拒绝，甚至被解聘。 本片贯穿始终的镜头是本斯坦独自一人在空荡荡的教室里，在黑板上一遍又一遍的写着：DO NOT QUESTION DARWINISM AUTHORITY不要质疑达尔文进化论的权威。而书写的过程中，他却抑制不住要说出他的心里话：作为一名学者，我热爱思考“我们从何处来，我们向何处去”这样深奥的问题，面对充满神奇的生命和丰富多彩的自然，我不能相信这些美好的事物是在粗放、偶然甚至带着些野蛮的自然进化中形成的，它们来自于神秘的智能设计。而人们现在更接受“进化论”，相信“物竞天择，适者生存”的法则，这是很危险的。上世纪三四十年代，德国纳粹不就是按照这个思路，做出了“生育最优秀的日耳曼人以及暴力消灭低劣民族”的丑陋行径吗？而在上世纪90年代，美国人竟也在进行类似的“优生运动”…… 当教授写满整整一黑板“DO NOT QUESTION DARWINISM AUTHORITY”的时候，电影完成了控诉。透过带着铁丝网的窗户，我们看到墙上科学家的肖像都被网格覆盖。啊！向“达尔文进化论”提出批判的理论已经被关入牢笼。……
