经过五百年的轮回，前作中《聪明伦文叙》中的明代状元伦文叙等人，一起穿越历史时空来到了现代社会，大家聚集在咸蛋小学。
在咸蛋小学里，主人公伦文叙机智聪明，才华横溢；伦文叙最好的搭档——欧小仙，是个看起来非常萌的小神仙，会一点奇妙但又不靠谱的法术。他们俩和活泼又捣蛋的同学和奇葩老师们弄得咸蛋小学不得安宁。
伦文叙和同学们在这个危机四伏却又充满温馨的校园内一起学习...